Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0F5

VPS26B, Vacuolar protein sorting-associated protein 26B, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS26BQ4G0F5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS26BQ4G0F5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS26BQ4G0F5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS26BQ4G0F5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS26BQ4G0F5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS26BQ4G0F5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS26BQ4G0F5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS26BQ4G0F5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS26BQ4G0F5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS26BQ4G0F5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS26BQ4G0F5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS26BQ4G0F5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS26BQ4G0F5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS26BQ4G0F5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS26BQ4G0F5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS26BQ4G0F5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS26BQ4G0F5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS26BQ4G0F5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS26BQ4G0F5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS26BQ4G0F5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS26BQ4G0F5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS26BQ4G0F5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS26BQ4G0F5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS26BQ4G0F5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS26BQ4G0F5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS26BQ4G0F5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS26BQ4G0F5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS26BQ4G0F5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS26BQ4G0F5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS26BQ4G0F5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS26BQ4G0F5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS26BQ4G0F5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS26BQ4G0F5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS26BQ4G0F5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS26BQ4G0F5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS26BQ4G0F5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS26BQ4G0F5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS26BQ4G0F5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS26BQ4G0F5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS26BQ4G0F5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS26BQ4G0F5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS26BQ4G0F5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS26BQ4G0F5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS26BQ4G0F5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS26BQ4G0F5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS26BQ4G0F5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS26BQ4G0F5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS26BQ4G0F5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS26BQ4G0F5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS26BQ4G0F5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS26BQ4G0F5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS26BQ4G0F5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS26BQ4G0F5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS26BQ4G0F5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS26BQ4G0F5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS26BQ4G0F5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS26BQ4G0F5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS26BQ4G0F5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS26BQ4G0F5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS26BQ4G0F5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS26BQ4G0F5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS26BQ4G0F5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS26BQ4G0F5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS26BQ4G0F5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS26BQ4G0F5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS26BQ4G0F5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS26BQ4G0F5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS26BQ4G0F5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS26BQ4G0F5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS26BQ4G0F5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS26BQ4G0F5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS26BQ4G0F5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS26BQ4G0F5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS26BQ4G0F5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS26BQ4G0F5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS26BQ4G0F5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS26BQ4G0F5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS26BQ4G0F5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS26BQ4G0F5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS26BQ4G0F5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS26BQ4G0F5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS26BQ4G0F5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS26BQ4G0F5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS26BQ4G0F5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS26BQ4G0F5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS26BQ4G0F5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS26BQ4G0F5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS26BQ4G0F5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS26BQ4G0F5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS26BQ4G0F5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS26BQ4G0F5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS26BQ4G0F5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS26BQ4G0F5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS26BQ4G0F5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS26BQ4G0F5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS26BQ4G0F5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS26BQ4G0F5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS26BQ4G0F5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS26BQ4G0F5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS26BQ4G0F5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms