Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSM12Q3MHD2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSM12Q3MHD2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSM12Q3MHD2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSM12Q3MHD2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LSM12Q3MHD2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSM12Q3MHD2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSM12Q3MHD2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSM12Q3MHD2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LSM12Q3MHD2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSM12Q3MHD2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSM12Q3MHD2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSM12Q3MHD2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LSM12Q3MHD2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSM12Q3MHD2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSM12Q3MHD2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LSM12Q3MHD2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LSM12Q3MHD2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LSM12Q3MHD2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LSM12Q3MHD2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LSM12Q3MHD2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LSM12Q3MHD2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LSM12Q3MHD2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LSM12Q3MHD2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LSM12Q3MHD2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSM12Q3MHD2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSM12Q3MHD2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSM12Q3MHD2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSM12Q3MHD2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSM12Q3MHD2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM12Q3MHD2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM12Q3MHD2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM12Q3MHD2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM12Q3MHD2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM12Q3MHD2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM12Q3MHD2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM12Q3MHD2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM12Q3MHD2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM12Q3MHD2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM12Q3MHD2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM12Q3MHD2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM12Q3MHD2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM12Q3MHD2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM12Q3MHD2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM12Q3MHD2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM12Q3MHD2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM12Q3MHD2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM12Q3MHD2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM12Q3MHD2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM12Q3MHD2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM12Q3MHD2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM12Q3MHD2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM12Q3MHD2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM12Q3MHD2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM12Q3MHD2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSM12Q3MHD2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSM12Q3MHD2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSM12Q3MHD2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSM12Q3MHD2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSM12Q3MHD2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSM12Q3MHD2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSM12Q3MHD2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LSM12Q3MHD2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LSM12Q3MHD2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LSM12Q3MHD2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LSM12Q3MHD2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LSM12Q3MHD2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms