Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IMPG1Q17R60 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IMPG1Q17R60 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IMPG1Q17R60 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IMPG1Q17R60 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IMPG1Q17R60 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IMPG1Q17R60 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IMPG1Q17R60 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IMPG1Q17R60 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IMPG1Q17R60 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IMPG1Q17R60 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IMPG1Q17R60 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IMPG1Q17R60 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IMPG1Q17R60 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IMPG1Q17R60 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IMPG1Q17R60 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IMPG1Q17R60 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IMPG1Q17R60 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IMPG1Q17R60 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IMPG1Q17R60 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IMPG1Q17R60 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IMPG1Q17R60 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IMPG1Q17R60 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IMPG1Q17R60 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IMPG1Q17R60 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IMPG1Q17R60 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IMPG1Q17R60 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IMPG1Q17R60 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IMPG1Q17R60 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IMPG1Q17R60 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IMPG1Q17R60 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IMPG1Q17R60 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IMPG1Q17R60 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IMPG1Q17R60 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IMPG1Q17R60 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IMPG1Q17R60 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IMPG1Q17R60 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IMPG1Q17R60 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IMPG1Q17R60 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IMPG1Q17R60 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IMPG1Q17R60 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IMPG1Q17R60 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IMPG1Q17R60 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IMPG1Q17R60 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IMPG1Q17R60 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IMPG1Q17R60 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IMPG1Q17R60 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IMPG1Q17R60 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IMPG1Q17R60 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IMPG1Q17R60 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IMPG1Q17R60 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IMPG1Q17R60 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IMPG1Q17R60 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IMPG1Q17R60 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IMPG1Q17R60 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IMPG1Q17R60 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
IMPG1Q17R60 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IMPG1Q17R60 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IMPG1Q17R60 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IMPG1Q17R60 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IMPG1Q17R60 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
IMPG1Q17R60 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IMPG1Q17R60 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IMPG1Q17R60 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IMPG1Q17R60 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IMPG1Q17R60 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IMPG1Q17R60 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IMPG1Q17R60 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IMPG1Q17R60 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IMPG1Q17R60 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IMPG1Q17R60 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IMPG1Q17R60 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IMPG1Q17R60 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IMPG1Q17R60 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IMPG1Q17R60 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IMPG1Q17R60 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IMPG1Q17R60 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IMPG1Q17R60 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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