Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRY1Q16526 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRY1Q16526 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRY1Q16526 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRY1Q16526 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRY1Q16526 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRY1Q16526 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRY1Q16526 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRY1Q16526 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRY1Q16526 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRY1Q16526 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRY1Q16526 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CRY1Q16526 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRY1Q16526 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRY1Q16526 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRY1Q16526 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRY1Q16526 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRY1Q16526 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRY1Q16526 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRY1Q16526 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRY1Q16526 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRY1Q16526 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRY1Q16526 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRY1Q16526 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRY1Q16526 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRY1Q16526 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRY1Q16526 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRY1Q16526 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRY1Q16526 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRY1Q16526 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRY1Q16526 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRY1Q16526 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRY1Q16526 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRY1Q16526 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRY1Q16526 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRY1Q16526 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRY1Q16526 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRY1Q16526 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRY1Q16526 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CRY1Q16526 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRY1Q16526 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRY1Q16526 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRY1Q16526 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRY1Q16526 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRY1Q16526 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRY1Q16526 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRY1Q16526 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CRY1Q16526 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CRY1Q16526 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRY1Q16526 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRY1Q16526 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRY1Q16526 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRY1Q16526 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CRY1Q16526 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRY1Q16526 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRY1Q16526 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRY1Q16526 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRY1Q16526 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRY1Q16526 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRY1Q16526 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRY1Q16526 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRY1Q16526 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRY1Q16526 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRY1Q16526 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRY1Q16526 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRY1Q16526 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRY1Q16526 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRY1Q16526 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRY1Q16526 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRY1Q16526 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRY1Q16526 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRY1Q16526 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRY1Q16526 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRY1Q16526 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRY1Q16526 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRY1Q16526 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRY1Q16526 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRY1Q16526 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRY1Q16526 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRY1Q16526 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRY1Q16526 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRY1Q16526 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRY1Q16526 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRY1Q16526 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CRY1Q16526 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRY1Q16526 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRY1Q16526 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRY1Q16526 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRY1Q16526 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRY1Q16526 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRY1Q16526 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRY1Q16526 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRY1Q16526 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRY1Q16526 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRY1Q16526 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRY1Q16526 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRY1Q16526 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRY1Q16526 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CRY1Q16526 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRY1Q16526 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms