Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NTRK3Q16288 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NTRK3Q16288 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NTRK3Q16288 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NTRK3Q16288 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NTRK3Q16288 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NTRK3Q16288 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NTRK3Q16288 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NTRK3Q16288 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NTRK3Q16288 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NTRK3Q16288 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NTRK3Q16288 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NTRK3Q16288 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NTRK3Q16288 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NTRK3Q16288 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NTRK3Q16288 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NTRK3Q16288 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NTRK3Q16288 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NTRK3Q16288 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
NTRK3Q16288 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NTRK3Q16288 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NTRK3Q16288 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NTRK3Q16288 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NTRK3Q16288 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NTRK3Q16288 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NTRK3Q16288 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NTRK3Q16288 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NTRK3Q16288 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NTRK3Q16288 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NTRK3Q16288 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NTRK3Q16288 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NTRK3Q16288 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NTRK3Q16288 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NTRK3Q16288 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NTRK3Q16288 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NTRK3Q16288 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NTRK3Q16288 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NTRK3Q16288 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NTRK3Q16288 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NTRK3Q16288 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NTRK3Q16288 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NTRK3Q16288 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NTRK3Q16288 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NTRK3Q16288 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NTRK3Q16288 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NTRK3Q16288 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NTRK3Q16288 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NTRK3Q16288 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NTRK3Q16288 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NTRK3Q16288 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NTRK3Q16288 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NTRK3Q16288 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NTRK3Q16288 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NTRK3Q16288 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NTRK3Q16288 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NTRK3Q16288 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NTRK3Q16288 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NTRK3Q16288 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NTRK3Q16288 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NTRK3Q16288 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NTRK3Q16288 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NTRK3Q16288 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NTRK3Q16288 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
NTRK3Q16288 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NTRK3Q16288 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NTRK3Q16288 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NTRK3Q16288 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NTRK3Q16288 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NTRK3Q16288 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NTRK3Q16288 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NTRK3Q16288 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NTRK3Q16288 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NTRK3Q16288 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NTRK3Q16288 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NTRK3Q16288 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NTRK3Q16288 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NTRK3Q16288 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NTRK3Q16288 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NTRK3Q16288 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NTRK3Q16288 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NTRK3Q16288 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NTRK3Q16288 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NTRK3Q16288 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NTRK3Q16288 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NTRK3Q16288 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NTRK3Q16288 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NTRK3Q16288 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NTRK3Q16288 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NTRK3Q16288 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NTRK3Q16288 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NTRK3Q16288 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NTRK3Q16288 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NTRK3Q16288 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NTRK3Q16288 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NTRK3Q16288 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NTRK3Q16288 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NTRK3Q16288 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NTRK3Q16288 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NTRK3Q16288 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NTRK3Q16288 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
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