Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
E2F4Q16254 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
E2F4Q16254 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
E2F4Q16254 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
E2F4Q16254 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
E2F4Q16254 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
E2F4Q16254 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
E2F4Q16254 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
E2F4Q16254 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
E2F4Q16254 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
E2F4Q16254 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
E2F4Q16254 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
E2F4Q16254 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
E2F4Q16254 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
E2F4Q16254 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
E2F4Q16254 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
E2F4Q16254 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
E2F4Q16254 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
E2F4Q16254 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
E2F4Q16254 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
E2F4Q16254 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
E2F4Q16254 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
E2F4Q16254 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
E2F4Q16254 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
E2F4Q16254 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
E2F4Q16254 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
E2F4Q16254 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
E2F4Q16254 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
E2F4Q16254 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
E2F4Q16254 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
E2F4Q16254 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
E2F4Q16254 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
E2F4Q16254 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
E2F4Q16254 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
E2F4Q16254 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
E2F4Q16254 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
E2F4Q16254 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
E2F4Q16254 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
E2F4Q16254 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
E2F4Q16254 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
E2F4Q16254 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
E2F4Q16254 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
E2F4Q16254 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
E2F4Q16254 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
E2F4Q16254 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
E2F4Q16254 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
E2F4Q16254 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
E2F4Q16254 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
E2F4Q16254 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
E2F4Q16254 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
E2F4Q16254 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
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