Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USF2Q15853 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USF2Q15853 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USF2Q15853 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
USF2Q15853 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USF2Q15853 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USF2Q15853 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USF2Q15853 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USF2Q15853 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USF2Q15853 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USF2Q15853 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USF2Q15853 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USF2Q15853 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USF2Q15853 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USF2Q15853 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USF2Q15853 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USF2Q15853 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USF2Q15853 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
USF2Q15853 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USF2Q15853 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USF2Q15853 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
USF2Q15853 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
USF2Q15853 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USF2Q15853 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
USF2Q15853 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USF2Q15853 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USF2Q15853 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USF2Q15853 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USF2Q15853 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USF2Q15853 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USF2Q15853 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USF2Q15853 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USF2Q15853 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USF2Q15853 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USF2Q15853 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USF2Q15853 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USF2Q15853 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
USF2Q15853 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USF2Q15853 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USF2Q15853 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USF2Q15853 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USF2Q15853 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USF2Q15853 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USF2Q15853 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USF2Q15853 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USF2Q15853 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USF2Q15853 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USF2Q15853 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USF2Q15853 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USF2Q15853 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USF2Q15853 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USF2Q15853 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USF2Q15853 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USF2Q15853 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USF2Q15853 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USF2Q15853 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USF2Q15853 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USF2Q15853 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USF2Q15853 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USF2Q15853 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USF2Q15853 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USF2Q15853 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USF2Q15853 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USF2Q15853 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
USF2Q15853 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
USF2Q15853 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
USF2Q15853 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
USF2Q15853 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USF2Q15853 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USF2Q15853 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USF2Q15853 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USF2Q15853 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USF2Q15853 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USF2Q15853 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USF2Q15853 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USF2Q15853 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USF2Q15853 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USF2Q15853 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USF2Q15853 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USF2Q15853 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USF2Q15853 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USF2Q15853 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USF2Q15853 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USF2Q15853 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USF2Q15853 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USF2Q15853 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USF2Q15853 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USF2Q15853 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USF2Q15853 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USF2Q15853 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USF2Q15853 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USF2Q15853 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USF2Q15853 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USF2Q15853 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USF2Q15853 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USF2Q15853 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USF2Q15853 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USF2Q15853 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
USF2Q15853 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USF2Q15853 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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