Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKD1Q15139 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKD1Q15139 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKD1Q15139 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKD1Q15139 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKD1Q15139 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKD1Q15139 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKD1Q15139 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKD1Q15139 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKD1Q15139 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKD1Q15139 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKD1Q15139 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKD1Q15139 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKD1Q15139 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKD1Q15139 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKD1Q15139 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKD1Q15139 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKD1Q15139 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKD1Q15139 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKD1Q15139 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKD1Q15139 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKD1Q15139 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKD1Q15139 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKD1Q15139 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKD1Q15139 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKD1Q15139 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKD1Q15139 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKD1Q15139 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKD1Q15139 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKD1Q15139 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKD1Q15139 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKD1Q15139 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKD1Q15139 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKD1Q15139 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKD1Q15139 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKD1Q15139 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRKD1Q15139 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRKD1Q15139 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKD1Q15139 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKD1Q15139 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKD1Q15139 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKD1Q15139 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKD1Q15139 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKD1Q15139 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKD1Q15139 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKD1Q15139 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKD1Q15139 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKD1Q15139 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKD1Q15139 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKD1Q15139 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKD1Q15139 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKD1Q15139 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKD1Q15139 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKD1Q15139 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKD1Q15139 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKD1Q15139 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKD1Q15139 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKD1Q15139 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKD1Q15139 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKD1Q15139 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKD1Q15139 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKD1Q15139 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKD1Q15139 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKD1Q15139 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKD1Q15139 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKD1Q15139 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKD1Q15139 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKD1Q15139 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKD1Q15139 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKD1Q15139 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKD1Q15139 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKD1Q15139 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKD1Q15139 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKD1Q15139 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKD1Q15139 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKD1Q15139 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKD1Q15139 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKD1Q15139 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKD1Q15139 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKD1Q15139 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKD1Q15139 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKD1Q15139 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKD1Q15139 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKD1Q15139 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKD1Q15139 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKD1Q15139 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKD1Q15139 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKD1Q15139 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms