Protein–RNA interactions for Protein: Q15047

SETDB1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETDB1Q15047 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SETDB1Q15047 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETDB1Q15047 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETDB1Q15047 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETDB1Q15047 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETDB1Q15047 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETDB1Q15047 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETDB1Q15047 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETDB1Q15047 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETDB1Q15047 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETDB1Q15047 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETDB1Q15047 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SETDB1Q15047 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SETDB1Q15047 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SETDB1Q15047 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SETDB1Q15047 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SETDB1Q15047 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SETDB1Q15047 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SETDB1Q15047 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SETDB1Q15047 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SETDB1Q15047 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETDB1Q15047 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETDB1Q15047 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETDB1Q15047 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETDB1Q15047 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SETDB1Q15047 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETDB1Q15047 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETDB1Q15047 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETDB1Q15047 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETDB1Q15047 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETDB1Q15047 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETDB1Q15047 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETDB1Q15047 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETDB1Q15047 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETDB1Q15047 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms