Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBX1Q14549 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBX1Q14549 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBX1Q14549 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBX1Q14549 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBX1Q14549 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBX1Q14549 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBX1Q14549 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBX1Q14549 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
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GBX1Q14549 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBX1Q14549 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBX1Q14549 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBX1Q14549 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBX1Q14549 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBX1Q14549 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBX1Q14549 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBX1Q14549 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBX1Q14549 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBX1Q14549 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBX1Q14549 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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GBX1Q14549 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBX1Q14549 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBX1Q14549 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
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GBX1Q14549 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GBX1Q14549 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
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GBX1Q14549 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GBX1Q14549 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
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GBX1Q14549 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GBX1Q14549 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GBX1Q14549 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GBX1Q14549 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GBX1Q14549 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GBX1Q14549 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GBX1Q14549 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GBX1Q14549 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBX1Q14549 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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GBX1Q14549 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBX1Q14549 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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GBX1Q14549 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBX1Q14549 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBX1Q14549 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBX1Q14549 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBX1Q14549 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
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GBX1Q14549 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBX1Q14549 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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GBX1Q14549 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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GBX1Q14549 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBX1Q14549 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBX1Q14549 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBX1Q14549 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
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GBX1Q14549 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBX1Q14549 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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GBX1Q14549 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBX1Q14549 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBX1Q14549 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
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GBX1Q14549 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GBX1Q14549 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBX1Q14549 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBX1Q14549 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBX1Q14549 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBX1Q14549 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBX1Q14549 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBX1Q14549 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
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