Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX39BQ13838 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX39BQ13838 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX39BQ13838 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX39BQ13838 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX39BQ13838 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX39BQ13838 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX39BQ13838 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX39BQ13838 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX39BQ13838 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX39BQ13838 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX39BQ13838 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX39BQ13838 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX39BQ13838 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX39BQ13838 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX39BQ13838 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX39BQ13838 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX39BQ13838 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX39BQ13838 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX39BQ13838 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX39BQ13838 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
DDX39BQ13838 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX39BQ13838 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX39BQ13838 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX39BQ13838 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX39BQ13838 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX39BQ13838 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX39BQ13838 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX39BQ13838 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX39BQ13838 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX39BQ13838 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX39BQ13838 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX39BQ13838 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX39BQ13838 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX39BQ13838 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX39BQ13838 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX39BQ13838 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX39BQ13838 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX39BQ13838 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX39BQ13838 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX39BQ13838 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX39BQ13838 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX39BQ13838 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX39BQ13838 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX39BQ13838 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX39BQ13838 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX39BQ13838 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX39BQ13838 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX39BQ13838 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX39BQ13838 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX39BQ13838 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX39BQ13838 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX39BQ13838 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX39BQ13838 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX39BQ13838 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX39BQ13838 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX39BQ13838 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX39BQ13838 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX39BQ13838 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX39BQ13838 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX39BQ13838 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX39BQ13838 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX39BQ13838 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX39BQ13838 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX39BQ13838 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX39BQ13838 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX39BQ13838 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX39BQ13838 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX39BQ13838 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX39BQ13838 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX39BQ13838 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX39BQ13838 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX39BQ13838 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX39BQ13838 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
DDX39BQ13838 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
DDX39BQ13838 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX39BQ13838 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX39BQ13838 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX39BQ13838 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX39BQ13838 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX39BQ13838 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX39BQ13838 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX39BQ13838 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX39BQ13838 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX39BQ13838 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX39BQ13838 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX39BQ13838 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX39BQ13838 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX39BQ13838 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX39BQ13838 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX39BQ13838 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX39BQ13838 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX39BQ13838 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX39BQ13838 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX39BQ13838 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX39BQ13838 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX39BQ13838 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX39BQ13838 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX39BQ13838 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX39BQ13838 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
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