Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMB3Q13751 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMB3Q13751 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMB3Q13751 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMB3Q13751 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMB3Q13751 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMB3Q13751 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMB3Q13751 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMB3Q13751 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMB3Q13751 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMB3Q13751 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMB3Q13751 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMB3Q13751 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMB3Q13751 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMB3Q13751 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMB3Q13751 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMB3Q13751 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMB3Q13751 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMB3Q13751 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMB3Q13751 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMB3Q13751 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMB3Q13751 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMB3Q13751 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMB3Q13751 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMB3Q13751 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMB3Q13751 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMB3Q13751 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMB3Q13751 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMB3Q13751 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMB3Q13751 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMB3Q13751 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LAMB3Q13751 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LAMB3Q13751 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LAMB3Q13751 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMB3Q13751 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMB3Q13751 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMB3Q13751 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMB3Q13751 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMB3Q13751 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMB3Q13751 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMB3Q13751 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMB3Q13751 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMB3Q13751 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMB3Q13751 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMB3Q13751 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMB3Q13751 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMB3Q13751 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMB3Q13751 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMB3Q13751 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMB3Q13751 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMB3Q13751 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMB3Q13751 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMB3Q13751 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMB3Q13751 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMB3Q13751 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMB3Q13751 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMB3Q13751 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMB3Q13751 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMB3Q13751 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMB3Q13751 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMB3Q13751 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMB3Q13751 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMB3Q13751 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMB3Q13751 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMB3Q13751 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMB3Q13751 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMB3Q13751 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMB3Q13751 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMB3Q13751 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMB3Q13751 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMB3Q13751 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMB3Q13751 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMB3Q13751 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMB3Q13751 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMB3Q13751 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMB3Q13751 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMB3Q13751 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMB3Q13751 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMB3Q13751 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMB3Q13751 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMB3Q13751 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMB3Q13751 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMB3Q13751 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMB3Q13751 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMB3Q13751 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMB3Q13751 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMB3Q13751 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMB3Q13751 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMB3Q13751 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMB3Q13751 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMB3Q13751 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMB3Q13751 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMB3Q13751 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMB3Q13751 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMB3Q13751 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMB3Q13751 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMB3Q13751 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMB3Q13751 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMB3Q13751 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMB3Q13751 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms