Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP1A4Q13733 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP1A4Q13733 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP1A4Q13733 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP1A4Q13733 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP1A4Q13733 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP1A4Q13733 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP1A4Q13733 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP1A4Q13733 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP1A4Q13733 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP1A4Q13733 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP1A4Q13733 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP1A4Q13733 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP1A4Q13733 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1A4Q13733 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1A4Q13733 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1A4Q13733 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1A4Q13733 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1A4Q13733 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1A4Q13733 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1A4Q13733 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1A4Q13733 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1A4Q13733 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1A4Q13733 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1A4Q13733 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1A4Q13733 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1A4Q13733 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1A4Q13733 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1A4Q13733 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1A4Q13733 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1A4Q13733 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1A4Q13733 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1A4Q13733 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1A4Q13733 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1A4Q13733 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1A4Q13733 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1A4Q13733 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1A4Q13733 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1A4Q13733 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1A4Q13733 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1A4Q13733 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1A4Q13733 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1A4Q13733 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1A4Q13733 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1A4Q13733 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1A4Q13733 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP1A4Q13733 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP1A4Q13733 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP1A4Q13733 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP1A4Q13733 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP1A4Q13733 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP1A4Q13733 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP1A4Q13733 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A4Q13733 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A4Q13733 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A4Q13733 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A4Q13733 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A4Q13733 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A4Q13733 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A4Q13733 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A4Q13733 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A4Q13733 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1A4Q13733 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A4Q13733 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A4Q13733 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A4Q13733 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A4Q13733 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A4Q13733 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A4Q13733 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A4Q13733 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A4Q13733 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A4Q13733 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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