Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IKZF1Q13422 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IKZF1Q13422 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IKZF1Q13422 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IKZF1Q13422 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IKZF1Q13422 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IKZF1Q13422 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IKZF1Q13422 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IKZF1Q13422 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
IKZF1Q13422 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IKZF1Q13422 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IKZF1Q13422 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IKZF1Q13422 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IKZF1Q13422 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IKZF1Q13422 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IKZF1Q13422 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IKZF1Q13422 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IKZF1Q13422 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IKZF1Q13422 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IKZF1Q13422 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
IKZF1Q13422 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IKZF1Q13422 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IKZF1Q13422 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IKZF1Q13422 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IKZF1Q13422 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IKZF1Q13422 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IKZF1Q13422 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IKZF1Q13422 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms