Protein–RNA interactions for Protein: Q13405

MRPL49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL49Q13405 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MRPL49Q13405 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MRPL49Q13405 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MRPL49Q13405 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MRPL49Q13405 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MRPL49Q13405 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MRPL49Q13405 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MRPL49Q13405 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MRPL49Q13405 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MRPL49Q13405 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MRPL49Q13405 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MRPL49Q13405 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MRPL49Q13405 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MRPL49Q13405 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MRPL49Q13405 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MRPL49Q13405 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21■□□□□ 0.95
MRPL49Q13405 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MRPL49Q13405 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21■□□□□ 0.95
MRPL49Q13405 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MRPL49Q13405 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MRPL49Q13405 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MRPL49Q13405 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MRPL49Q13405 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MRPL49Q13405 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MRPL49Q13405 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MRPL49Q13405 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MRPL49Q13405 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MRPL49Q13405 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MRPL49Q13405 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
MRPL49Q13405 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MRPL49Q13405 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MRPL49Q13405 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MRPL49Q13405 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MRPL49Q13405 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MRPL49Q13405 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MRPL49Q13405 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MRPL49Q13405 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MRPL49Q13405 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MRPL49Q13405 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
MRPL49Q13405 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
MRPL49Q13405 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MRPL49Q13405 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MRPL49Q13405 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MRPL49Q13405 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MRPL49Q13405 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MRPL49Q13405 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MRPL49Q13405 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MRPL49Q13405 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MRPL49Q13405 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
MRPL49Q13405 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MRPL49Q13405 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MRPL49Q13405 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
MRPL49Q13405 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MRPL49Q13405 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MRPL49Q13405 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MRPL49Q13405 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MRPL49Q13405 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MRPL49Q13405 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MRPL49Q13405 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
MRPL49Q13405 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MRPL49Q13405 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MRPL49Q13405 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MRPL49Q13405 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MRPL49Q13405 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MRPL49Q13405 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MRPL49Q13405 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MRPL49Q13405 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MRPL49Q13405 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MRPL49Q13405 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MRPL49Q13405 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MRPL49Q13405 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MRPL49Q13405 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MRPL49Q13405 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MRPL49Q13405 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MRPL49Q13405 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MRPL49Q13405 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRPL49Q13405 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRPL49Q13405 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRPL49Q13405 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRPL49Q13405 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
MRPL49Q13405 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRPL49Q13405 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRPL49Q13405 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRPL49Q13405 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRPL49Q13405 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRPL49Q13405 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
MRPL49Q13405 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRPL49Q13405 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRPL49Q13405 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRPL49Q13405 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRPL49Q13405 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRPL49Q13405 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRPL49Q13405 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRPL49Q13405 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRPL49Q13405 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRPL49Q13405 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MRPL49Q13405 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MRPL49Q13405 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MRPL49Q13405 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MRPL49Q13405 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms