Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SPOCK1Q08629 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms