Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PUDPQ08623 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms