Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4CQ08493 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4CQ08493 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4CQ08493 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4CQ08493 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4CQ08493 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4CQ08493 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4CQ08493 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4CQ08493 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4CQ08493 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4CQ08493 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4CQ08493 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE4CQ08493 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE4CQ08493 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE4CQ08493 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE4CQ08493 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE4CQ08493 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE4CQ08493 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE4CQ08493 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE4CQ08493 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE4CQ08493 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE4CQ08493 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE4CQ08493 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4CQ08493 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4CQ08493 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4CQ08493 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4CQ08493 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4CQ08493 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4CQ08493 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4CQ08493 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4CQ08493 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4CQ08493 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4CQ08493 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4CQ08493 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE4CQ08493 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE4CQ08493 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE4CQ08493 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE4CQ08493 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE4CQ08493 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE4CQ08493 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4CQ08493 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4CQ08493 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4CQ08493 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4CQ08493 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4CQ08493 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4CQ08493 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4CQ08493 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4CQ08493 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4CQ08493 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4CQ08493 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE4CQ08493 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE4CQ08493 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE4CQ08493 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE4CQ08493 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE4CQ08493 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PDE4CQ08493 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PDE4CQ08493 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PDE4CQ08493 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PDE4CQ08493 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4CQ08493 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4CQ08493 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4CQ08493 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4CQ08493 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4CQ08493 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4CQ08493 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4CQ08493 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4CQ08493 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4CQ08493 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4CQ08493 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4CQ08493 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE4CQ08493 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4CQ08493 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4CQ08493 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4CQ08493 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4CQ08493 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4CQ08493 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4CQ08493 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4CQ08493 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE4CQ08493 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4CQ08493 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4CQ08493 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4CQ08493 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4CQ08493 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4CQ08493 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4CQ08493 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4CQ08493 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4CQ08493 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4CQ08493 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE4CQ08493 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4CQ08493 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4CQ08493 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4CQ08493 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4CQ08493 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4CQ08493 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4CQ08493 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4CQ08493 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4CQ08493 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4CQ08493 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4CQ08493 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4CQ08493 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms