Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LOXL1Q08397 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms