Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC3A1Q07837 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC3A1Q07837 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC3A1Q07837 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC3A1Q07837 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC3A1Q07837 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC3A1Q07837 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC3A1Q07837 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC3A1Q07837 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC3A1Q07837 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC3A1Q07837 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC3A1Q07837 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC3A1Q07837 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC3A1Q07837 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC3A1Q07837 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC3A1Q07837 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC3A1Q07837 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC3A1Q07837 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC3A1Q07837 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC3A1Q07837 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC3A1Q07837 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC3A1Q07837 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC3A1Q07837 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC3A1Q07837 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC3A1Q07837 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC3A1Q07837 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC3A1Q07837 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC3A1Q07837 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC3A1Q07837 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC3A1Q07837 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC3A1Q07837 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC3A1Q07837 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC3A1Q07837 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC3A1Q07837 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC3A1Q07837 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC3A1Q07837 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC3A1Q07837 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC3A1Q07837 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC3A1Q07837 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC3A1Q07837 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC3A1Q07837 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC3A1Q07837 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC3A1Q07837 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC3A1Q07837 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC3A1Q07837 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC3A1Q07837 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC3A1Q07837 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms