Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN1BQ07699 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN1BQ07699 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN1BQ07699 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN1BQ07699 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN1BQ07699 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN1BQ07699 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN1BQ07699 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN1BQ07699 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN1BQ07699 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN1BQ07699 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN1BQ07699 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN1BQ07699 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN1BQ07699 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN1BQ07699 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN1BQ07699 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN1BQ07699 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN1BQ07699 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN1BQ07699 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN1BQ07699 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN1BQ07699 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN1BQ07699 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN1BQ07699 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN1BQ07699 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN1BQ07699 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN1BQ07699 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCN1BQ07699 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCN1BQ07699 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCN1BQ07699 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCN1BQ07699 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCN1BQ07699 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCN1BQ07699 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCN1BQ07699 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCN1BQ07699 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCN1BQ07699 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCN1BQ07699 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCN1BQ07699 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCN1BQ07699 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCN1BQ07699 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCN1BQ07699 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCN1BQ07699 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCN1BQ07699 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCN1BQ07699 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCN1BQ07699 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCN1BQ07699 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCN1BQ07699 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCN1BQ07699 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCN1BQ07699 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCN1BQ07699 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCN1BQ07699 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCN1BQ07699 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCN1BQ07699 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCN1BQ07699 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCN1BQ07699 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCN1BQ07699 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCN1BQ07699 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCN1BQ07699 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCN1BQ07699 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCN1BQ07699 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCN1BQ07699 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCN1BQ07699 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCN1BQ07699 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCN1BQ07699 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCN1BQ07699 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCN1BQ07699 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCN1BQ07699 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCN1BQ07699 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN1BQ07699 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN1BQ07699 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN1BQ07699 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN1BQ07699 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN1BQ07699 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN1BQ07699 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN1BQ07699 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN1BQ07699 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN1BQ07699 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN1BQ07699 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN1BQ07699 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN1BQ07699 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN1BQ07699 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN1BQ07699 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN1BQ07699 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN1BQ07699 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN1BQ07699 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN1BQ07699 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN1BQ07699 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN1BQ07699 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN1BQ07699 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN1BQ07699 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN1BQ07699 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN1BQ07699 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN1BQ07699 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN1BQ07699 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN1BQ07699 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN1BQ07699 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN1BQ07699 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN1BQ07699 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN1BQ07699 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN1BQ07699 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN1BQ07699 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms