Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CD164Q04900 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CD164Q04900 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CD164Q04900 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CD164Q04900 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CD164Q04900 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CD164Q04900 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CD164Q04900 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CD164Q04900 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CD164Q04900 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CD164Q04900 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CD164Q04900 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CD164Q04900 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CD164Q04900 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CD164Q04900 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CD164Q04900 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CD164Q04900 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CD164Q04900 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CD164Q04900 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CD164Q04900 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CD164Q04900 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD164Q04900 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD164Q04900 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD164Q04900 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD164Q04900 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD164Q04900 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD164Q04900 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD164Q04900 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD164Q04900 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CD164Q04900 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD164Q04900 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD164Q04900 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CD164Q04900 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD164Q04900 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD164Q04900 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD164Q04900 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD164Q04900 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD164Q04900 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD164Q04900 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD164Q04900 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD164Q04900 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD164Q04900 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CD164Q04900 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD164Q04900 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD164Q04900 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD164Q04900 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CD164Q04900 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD164Q04900 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD164Q04900 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD164Q04900 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD164Q04900 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD164Q04900 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD164Q04900 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD164Q04900 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CD164Q04900 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CD164Q04900 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CD164Q04900 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CD164Q04900 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CD164Q04900 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD164Q04900 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD164Q04900 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD164Q04900 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD164Q04900 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD164Q04900 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CD164Q04900 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD164Q04900 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD164Q04900 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD164Q04900 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD164Q04900 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD164Q04900 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD164Q04900 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD164Q04900 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD164Q04900 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD164Q04900 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD164Q04900 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD164Q04900 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD164Q04900 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD164Q04900 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD164Q04900 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD164Q04900 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD164Q04900 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD164Q04900 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD164Q04900 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD164Q04900 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD164Q04900 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD164Q04900 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD164Q04900 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD164Q04900 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD164Q04900 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD164Q04900 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD164Q04900 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CD164Q04900 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD164Q04900 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD164Q04900 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD164Q04900 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD164Q04900 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD164Q04900 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD164Q04900 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD164Q04900 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD164Q04900 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms