Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPCQ03188 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPCQ03188 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPCQ03188 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPCQ03188 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPCQ03188 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPCQ03188 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPCQ03188 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPCQ03188 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPCQ03188 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPCQ03188 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPCQ03188 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPCQ03188 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPCQ03188 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPCQ03188 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPCQ03188 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPCQ03188 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPCQ03188 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPCQ03188 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPCQ03188 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPCQ03188 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPCQ03188 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPCQ03188 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPCQ03188 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPCQ03188 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPCQ03188 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPCQ03188 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPCQ03188 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPCQ03188 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPCQ03188 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPCQ03188 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPCQ03188 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPCQ03188 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPCQ03188 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPCQ03188 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPCQ03188 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPCQ03188 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPCQ03188 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPCQ03188 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPCQ03188 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPCQ03188 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPCQ03188 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPCQ03188 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPCQ03188 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPCQ03188 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPCQ03188 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPCQ03188 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPCQ03188 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPCQ03188 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPCQ03188 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPCQ03188 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPCQ03188 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPCQ03188 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPCQ03188 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPCQ03188 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPCQ03188 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPCQ03188 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPCQ03188 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPCQ03188 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPCQ03188 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CENPCQ03188 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
CENPCQ03188 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPCQ03188 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPCQ03188 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPCQ03188 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPCQ03188 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPCQ03188 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPCQ03188 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPCQ03188 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPCQ03188 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPCQ03188 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPCQ03188 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPCQ03188 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPCQ03188 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPCQ03188 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPCQ03188 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPCQ03188 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPCQ03188 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPCQ03188 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPCQ03188 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPCQ03188 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPCQ03188 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPCQ03188 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPCQ03188 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPCQ03188 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPCQ03188 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPCQ03188 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPCQ03188 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPCQ03188 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPCQ03188 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPCQ03188 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPCQ03188 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPCQ03188 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPCQ03188 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPCQ03188 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPCQ03188 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPCQ03188 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPCQ03188 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPCQ03188 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPCQ03188 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms