Protein–RNA interactions for Protein: P98196

ATP11A, Probable phospholipid-transporting ATPase IH, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11AP98196 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP11AP98196 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP11AP98196 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP11AP98196 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP11AP98196 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP11AP98196 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP11AP98196 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP11AP98196 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP11AP98196 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP11AP98196 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP11AP98196 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP11AP98196 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP11AP98196 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP11AP98196 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP11AP98196 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP11AP98196 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP11AP98196 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP11AP98196 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP11AP98196 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP11AP98196 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATP11AP98196 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATP11AP98196 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP11AP98196 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP11AP98196 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP11AP98196 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP11AP98196 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP11AP98196 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP11AP98196 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP11AP98196 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP11AP98196 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP11AP98196 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP11AP98196 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP11AP98196 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP11AP98196 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP11AP98196 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP11AP98196 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP11AP98196 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP11AP98196 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP11AP98196 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP11AP98196 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP11AP98196 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP11AP98196 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP11AP98196 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP11AP98196 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP11AP98196 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP11AP98196 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP11AP98196 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP11AP98196 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP11AP98196 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP11AP98196 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP11AP98196 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP11AP98196 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP11AP98196 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP11AP98196 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP11AP98196 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP11AP98196 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP11AP98196 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP11AP98196 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP11AP98196 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP11AP98196 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP11AP98196 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP11AP98196 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP11AP98196 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP11AP98196 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP11AP98196 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP11AP98196 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP11AP98196 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP11AP98196 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP11AP98196 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP11AP98196 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP11AP98196 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP11AP98196 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP11AP98196 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP11AP98196 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP11AP98196 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP11AP98196 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP11AP98196 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP11AP98196 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP11AP98196 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP11AP98196 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP11AP98196 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP11AP98196 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP11AP98196 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP11AP98196 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP11AP98196 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP11AP98196 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP11AP98196 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP11AP98196 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP11AP98196 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP11AP98196 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP11AP98196 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP11AP98196 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP11AP98196 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP11AP98196 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP11AP98196 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP11AP98196 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP11AP98196 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP11AP98196 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP11AP98196 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP11AP98196 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms