Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSBP2P81877 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SSBP2P81877 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms