Protein–RNA interactions for Protein: P62318

SNRPD3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD3P62318 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPD3P62318 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms