Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms