Protein–RNA interactions for Protein: P61077

UBE2D3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D3P61077 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2D3P61077 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms