Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVFRD-1P60508 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVFRD-1P60508 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVFRD-1P60508 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVFRD-1P60508 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms