Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LOXL3P58215 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LOXL3P58215 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms