Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EEFSECP57772 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EEFSECP57772 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EEFSECP57772 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EEFSECP57772 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EEFSECP57772 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EEFSECP57772 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EEFSECP57772 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EEFSECP57772 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EEFSECP57772 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EEFSECP57772 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EEFSECP57772 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EEFSECP57772 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EEFSECP57772 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EEFSECP57772 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EEFSECP57772 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EEFSECP57772 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EEFSECP57772 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
EEFSECP57772 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EEFSECP57772 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EEFSECP57772 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EEFSECP57772 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EEFSECP57772 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EEFSECP57772 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EEFSECP57772 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
EEFSECP57772 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EEFSECP57772 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EEFSECP57772 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EEFSECP57772 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EEFSECP57772 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EEFSECP57772 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EEFSECP57772 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EEFSECP57772 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
EEFSECP57772 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EEFSECP57772 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EEFSECP57772 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EEFSECP57772 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EEFSECP57772 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EEFSECP57772 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EEFSECP57772 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EEFSECP57772 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EEFSECP57772 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EEFSECP57772 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EEFSECP57772 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EEFSECP57772 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EEFSECP57772 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EEFSECP57772 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EEFSECP57772 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EEFSECP57772 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EEFSECP57772 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
EEFSECP57772 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EEFSECP57772 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EEFSECP57772 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EEFSECP57772 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EEFSECP57772 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EEFSECP57772 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EEFSECP57772 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EEFSECP57772 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EEFSECP57772 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EEFSECP57772 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms