Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC12A2P55011 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC12A2P55011 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC12A2P55011 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC12A2P55011 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC12A2P55011 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC12A2P55011 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC12A2P55011 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC12A2P55011 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC12A2P55011 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC12A2P55011 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC12A2P55011 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC12A2P55011 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC12A2P55011 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC12A2P55011 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC12A2P55011 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC12A2P55011 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC12A2P55011 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC12A2P55011 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC12A2P55011 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC12A2P55011 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC12A2P55011 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC12A2P55011 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC12A2P55011 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC12A2P55011 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC12A2P55011 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC12A2P55011 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC12A2P55011 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC12A2P55011 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC12A2P55011 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC12A2P55011 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC12A2P55011 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC12A2P55011 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC12A2P55011 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC12A2P55011 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC12A2P55011 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC12A2P55011 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC12A2P55011 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC12A2P55011 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC12A2P55011 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC12A2P55011 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC12A2P55011 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC12A2P55011 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC12A2P55011 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC12A2P55011 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC12A2P55011 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC12A2P55011 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC12A2P55011 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC12A2P55011 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC12A2P55011 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC12A2P55011 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC12A2P55011 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC12A2P55011 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC12A2P55011 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC12A2P55011 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC12A2P55011 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC12A2P55011 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC12A2P55011 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC12A2P55011 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC12A2P55011 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC12A2P55011 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC12A2P55011 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC12A2P55011 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC12A2P55011 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC12A2P55011 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC12A2P55011 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC12A2P55011 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC12A2P55011 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC12A2P55011 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC12A2P55011 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC12A2P55011 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC12A2P55011 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC12A2P55011 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC12A2P55011 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC12A2P55011 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC12A2P55011 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC12A2P55011 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC12A2P55011 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC12A2P55011 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC12A2P55011 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC12A2P55011 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC12A2P55011 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC12A2P55011 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC12A2P55011 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC12A2P55011 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC12A2P55011 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC12A2P55011 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC12A2P55011 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC12A2P55011 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC12A2P55011 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC12A2P55011 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC12A2P55011 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC12A2P55011 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC12A2P55011 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC12A2P55011 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC12A2P55011 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC12A2P55011 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC12A2P55011 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC12A2P55011 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC12A2P55011 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms