Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP12AP54707 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms