Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMSP52788 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMSP52788 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMSP52788 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMSP52788 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SMSP52788 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMSP52788 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMSP52788 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMSP52788 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMSP52788 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMSP52788 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMSP52788 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMSP52788 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMSP52788 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMSP52788 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMSP52788 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMSP52788 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMSP52788 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMSP52788 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMSP52788 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMSP52788 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SMSP52788 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMSP52788 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMSP52788 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SMSP52788 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMSP52788 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMSP52788 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMSP52788 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMSP52788 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMSP52788 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMSP52788 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMSP52788 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMSP52788 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMSP52788 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMSP52788 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMSP52788 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMSP52788 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMSP52788 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMSP52788 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMSP52788 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMSP52788 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMSP52788 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMSP52788 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMSP52788 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMSP52788 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMSP52788 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMSP52788 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMSP52788 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMSP52788 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMSP52788 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMSP52788 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMSP52788 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMSP52788 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMSP52788 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMSP52788 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMSP52788 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMSP52788 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMSP52788 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMSP52788 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMSP52788 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMSP52788 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMSP52788 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMSP52788 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMSP52788 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMSP52788 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMSP52788 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMSP52788 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMSP52788 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMSP52788 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMSP52788 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMSP52788 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMSP52788 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMSP52788 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMSP52788 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMSP52788 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMSP52788 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMSP52788 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMSP52788 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMSP52788 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMSP52788 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMSP52788 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMSP52788 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMSP52788 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMSP52788 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMSP52788 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMSP52788 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMSP52788 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMSP52788 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMSP52788 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMSP52788 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMSP52788 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMSP52788 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMSP52788 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMSP52788 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMSP52788 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMSP52788 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMSP52788 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMSP52788 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMSP52788 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMSP52788 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms