Protein–RNA interactions for Protein: P51955

NEK2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK2P51955 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK2P51955 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK2P51955 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK2P51955 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK2P51955 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK2P51955 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK2P51955 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK2P51955 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK2P51955 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK2P51955 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK2P51955 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK2P51955 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK2P51955 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK2P51955 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK2P51955 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK2P51955 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK2P51955 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK2P51955 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK2P51955 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK2P51955 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK2P51955 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK2P51955 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK2P51955 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK2P51955 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK2P51955 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK2P51955 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK2P51955 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK2P51955 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK2P51955 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK2P51955 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK2P51955 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK2P51955 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK2P51955 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEK2P51955 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEK2P51955 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEK2P51955 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEK2P51955 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEK2P51955 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEK2P51955 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEK2P51955 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEK2P51955 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEK2P51955 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEK2P51955 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEK2P51955 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEK2P51955 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEK2P51955 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NEK2P51955 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK2P51955 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK2P51955 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK2P51955 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK2P51955 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK2P51955 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK2P51955 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK2P51955 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK2P51955 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK2P51955 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK2P51955 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK2P51955 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEK2P51955 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEK2P51955 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEK2P51955 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEK2P51955 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEK2P51955 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEK2P51955 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEK2P51955 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEK2P51955 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEK2P51955 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEK2P51955 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEK2P51955 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK2P51955 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK2P51955 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK2P51955 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK2P51955 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK2P51955 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK2P51955 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK2P51955 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK2P51955 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK2P51955 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK2P51955 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK2P51955 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK2P51955 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK2P51955 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEK2P51955 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEK2P51955 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEK2P51955 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NEK2P51955 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEK2P51955 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEK2P51955 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEK2P51955 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEK2P51955 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEK2P51955 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEK2P51955 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEK2P51955 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEK2P51955 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEK2P51955 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEK2P51955 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEK2P51955 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEK2P51955 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEK2P51955 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEK2P51955 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms