Protein–RNA interactions for Protein: P51797

CLCN6, Chloride transport protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN6P51797 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CLCN6P51797 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLCN6P51797 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLCN6P51797 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLCN6P51797 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLCN6P51797 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLCN6P51797 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLCN6P51797 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLCN6P51797 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCN6P51797 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCN6P51797 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCN6P51797 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCN6P51797 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCN6P51797 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCN6P51797 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCN6P51797 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCN6P51797 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCN6P51797 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCN6P51797 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCN6P51797 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCN6P51797 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCN6P51797 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCN6P51797 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLCN6P51797 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLCN6P51797 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLCN6P51797 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLCN6P51797 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLCN6P51797 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLCN6P51797 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLCN6P51797 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CLCN6P51797 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLCN6P51797 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLCN6P51797 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLCN6P51797 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLCN6P51797 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLCN6P51797 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLCN6P51797 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLCN6P51797 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLCN6P51797 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLCN6P51797 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLCN6P51797 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLCN6P51797 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLCN6P51797 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLCN6P51797 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLCN6P51797 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLCN6P51797 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLCN6P51797 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLCN6P51797 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CLCN6P51797 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLCN6P51797 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLCN6P51797 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLCN6P51797 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLCN6P51797 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLCN6P51797 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLCN6P51797 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLCN6P51797 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLCN6P51797 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLCN6P51797 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLCN6P51797 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLCN6P51797 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLCN6P51797 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLCN6P51797 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLCN6P51797 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLCN6P51797 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLCN6P51797 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLCN6P51797 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLCN6P51797 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLCN6P51797 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLCN6P51797 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLCN6P51797 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLCN6P51797 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLCN6P51797 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLCN6P51797 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLCN6P51797 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLCN6P51797 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLCN6P51797 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLCN6P51797 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CLCN6P51797 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLCN6P51797 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLCN6P51797 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CLCN6P51797 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CLCN6P51797 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLCN6P51797 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLCN6P51797 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLCN6P51797 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLCN6P51797 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLCN6P51797 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLCN6P51797 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLCN6P51797 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLCN6P51797 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLCN6P51797 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLCN6P51797 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLCN6P51797 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLCN6P51797 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CLCN6P51797 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLCN6P51797 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLCN6P51797 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLCN6P51797 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLCN6P51797 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLCN6P51797 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms