Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE6CP51160 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE6CP51160 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE6CP51160 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE6CP51160 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE6CP51160 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE6CP51160 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE6CP51160 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE6CP51160 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDE6CP51160 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDE6CP51160 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PDE6CP51160 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDE6CP51160 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDE6CP51160 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDE6CP51160 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE6CP51160 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE6CP51160 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE6CP51160 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE6CP51160 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE6CP51160 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE6CP51160 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE6CP51160 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE6CP51160 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE6CP51160 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE6CP51160 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE6CP51160 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE6CP51160 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE6CP51160 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE6CP51160 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE6CP51160 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE6CP51160 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE6CP51160 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE6CP51160 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE6CP51160 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE6CP51160 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE6CP51160 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE6CP51160 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE6CP51160 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE6CP51160 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE6CP51160 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE6CP51160 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE6CP51160 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE6CP51160 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE6CP51160 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE6CP51160 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE6CP51160 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE6CP51160 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE6CP51160 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE6CP51160 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE6CP51160 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE6CP51160 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE6CP51160 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE6CP51160 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE6CP51160 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE6CP51160 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE6CP51160 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE6CP51160 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE6CP51160 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE6CP51160 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE6CP51160 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE6CP51160 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE6CP51160 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE6CP51160 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE6CP51160 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE6CP51160 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE6CP51160 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE6CP51160 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE6CP51160 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE6CP51160 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE6CP51160 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE6CP51160 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE6CP51160 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE6CP51160 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE6CP51160 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE6CP51160 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE6CP51160 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE6CP51160 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE6CP51160 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE6CP51160 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE6CP51160 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE6CP51160 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE6CP51160 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE6CP51160 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE6CP51160 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE6CP51160 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE6CP51160 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE6CP51160 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE6CP51160 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE6CP51160 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE6CP51160 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE6CP51160 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE6CP51160 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE6CP51160 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE6CP51160 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE6CP51160 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE6CP51160 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE6CP51160 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE6CP51160 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE6CP51160 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE6CP51160 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms