Protein–RNA interactions for Protein: P49005

POLD2, DNA polymerase delta subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD2P49005 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLD2P49005 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLD2P49005 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLD2P49005 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLD2P49005 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLD2P49005 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLD2P49005 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLD2P49005 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLD2P49005 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLD2P49005 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLD2P49005 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLD2P49005 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLD2P49005 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLD2P49005 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLD2P49005 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLD2P49005 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLD2P49005 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLD2P49005 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLD2P49005 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLD2P49005 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLD2P49005 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLD2P49005 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
POLD2P49005 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
POLD2P49005 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLD2P49005 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLD2P49005 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLD2P49005 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLD2P49005 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLD2P49005 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLD2P49005 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLD2P49005 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLD2P49005 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLD2P49005 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLD2P49005 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLD2P49005 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLD2P49005 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLD2P49005 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLD2P49005 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLD2P49005 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLD2P49005 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLD2P49005 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLD2P49005 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLD2P49005 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLD2P49005 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLD2P49005 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLD2P49005 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLD2P49005 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLD2P49005 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLD2P49005 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLD2P49005 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLD2P49005 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLD2P49005 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLD2P49005 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLD2P49005 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLD2P49005 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLD2P49005 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLD2P49005 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLD2P49005 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLD2P49005 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLD2P49005 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLD2P49005 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLD2P49005 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLD2P49005 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLD2P49005 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLD2P49005 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLD2P49005 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLD2P49005 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLD2P49005 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLD2P49005 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLD2P49005 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLD2P49005 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLD2P49005 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
POLD2P49005 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLD2P49005 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLD2P49005 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLD2P49005 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
POLD2P49005 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLD2P49005 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLD2P49005 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLD2P49005 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLD2P49005 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLD2P49005 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLD2P49005 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLD2P49005 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
POLD2P49005 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLD2P49005 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLD2P49005 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLD2P49005 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLD2P49005 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLD2P49005 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLD2P49005 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLD2P49005 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLD2P49005 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLD2P49005 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLD2P49005 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLD2P49005 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLD2P49005 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLD2P49005 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLD2P49005 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLD2P49005 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms