Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRPC1P48995 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRPC1P48995 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPC1P48995 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPC1P48995 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPC1P48995 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPC1P48995 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPC1P48995 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPC1P48995 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPC1P48995 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPC1P48995 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPC1P48995 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPC1P48995 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPC1P48995 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPC1P48995 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPC1P48995 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPC1P48995 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPC1P48995 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPC1P48995 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPC1P48995 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPC1P48995 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRPC1P48995 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRPC1P48995 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRPC1P48995 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRPC1P48995 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TRPC1P48995 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRPC1P48995 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRPC1P48995 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRPC1P48995 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRPC1P48995 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRPC1P48995 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRPC1P48995 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRPC1P48995 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRPC1P48995 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRPC1P48995 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRPC1P48995 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRPC1P48995 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms