Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC6A9P48067 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC6A9P48067 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC6A9P48067 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms