Protein–RNA interactions for Protein: P47992

XCL1, Lymphotactin, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL1P47992 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCL1P47992 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCL1P47992 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCL1P47992 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCL1P47992 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCL1P47992 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCL1P47992 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCL1P47992 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCL1P47992 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCL1P47992 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCL1P47992 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XCL1P47992 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XCL1P47992 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XCL1P47992 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XCL1P47992 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XCL1P47992 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XCL1P47992 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XCL1P47992 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XCL1P47992 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XCL1P47992 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
XCL1P47992 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
XCL1P47992 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
XCL1P47992 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
XCL1P47992 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
XCL1P47992 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
XCL1P47992 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
XCL1P47992 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
XCL1P47992 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
XCL1P47992 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCL1P47992 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCL1P47992 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCL1P47992 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
XCL1P47992 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCL1P47992 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCL1P47992 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCL1P47992 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCL1P47992 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCL1P47992 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCL1P47992 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCL1P47992 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCL1P47992 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCL1P47992 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCL1P47992 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCL1P47992 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCL1P47992 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCL1P47992 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCL1P47992 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCL1P47992 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCL1P47992 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCL1P47992 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCL1P47992 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCL1P47992 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCL1P47992 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCL1P47992 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCL1P47992 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
XCL1P47992 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCL1P47992 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCL1P47992 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCL1P47992 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCL1P47992 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCL1P47992 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCL1P47992 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCL1P47992 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCL1P47992 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCL1P47992 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCL1P47992 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCL1P47992 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCL1P47992 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCL1P47992 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCL1P47992 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCL1P47992 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCL1P47992 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCL1P47992 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCL1P47992 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCL1P47992 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCL1P47992 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCL1P47992 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCL1P47992 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCL1P47992 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCL1P47992 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCL1P47992 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
XCL1P47992 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCL1P47992 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCL1P47992 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCL1P47992 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCL1P47992 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
XCL1P47992 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCL1P47992 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCL1P47992 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCL1P47992 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCL1P47992 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCL1P47992 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCL1P47992 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
XCL1P47992 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XCL1P47992 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XCL1P47992 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XCL1P47992 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XCL1P47992 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XCL1P47992 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
XCL1P47992 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms