Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSR1P43307 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSR1P43307 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSR1P43307 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSR1P43307 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSR1P43307 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSR1P43307 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSR1P43307 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSR1P43307 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSR1P43307 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSR1P43307 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSR1P43307 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SSR1P43307 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSR1P43307 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSR1P43307 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSR1P43307 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSR1P43307 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSR1P43307 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSR1P43307 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSR1P43307 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSR1P43307 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSR1P43307 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSR1P43307 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSR1P43307 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SSR1P43307 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SSR1P43307 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSR1P43307 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSR1P43307 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSR1P43307 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SSR1P43307 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SSR1P43307 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSR1P43307 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSR1P43307 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSR1P43307 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSR1P43307 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSR1P43307 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSR1P43307 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSR1P43307 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSR1P43307 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSR1P43307 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSR1P43307 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSR1P43307 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSR1P43307 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSR1P43307 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSR1P43307 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSR1P43307 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSR1P43307 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSR1P43307 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSR1P43307 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSR1P43307 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSR1P43307 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSR1P43307 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSR1P43307 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSR1P43307 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSR1P43307 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSR1P43307 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSR1P43307 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSR1P43307 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSR1P43307 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSR1P43307 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSR1P43307 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSR1P43307 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSR1P43307 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSR1P43307 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSR1P43307 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSR1P43307 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSR1P43307 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSR1P43307 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSR1P43307 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSR1P43307 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSR1P43307 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSR1P43307 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSR1P43307 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSR1P43307 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSR1P43307 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSR1P43307 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSR1P43307 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SSR1P43307 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSR1P43307 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSR1P43307 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSR1P43307 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSR1P43307 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSR1P43307 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSR1P43307 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSR1P43307 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSR1P43307 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSR1P43307 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SSR1P43307 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSR1P43307 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSR1P43307 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSR1P43307 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSR1P43307 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSR1P43307 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSR1P43307 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSR1P43307 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSR1P43307 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSR1P43307 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSR1P43307 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SSR1P43307 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSR1P43307 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms