Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPHP41219 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPHP41219 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRPHP41219 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRPHP41219 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRPHP41219 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRPHP41219 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRPHP41219 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPHP41219 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPHP41219 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPHP41219 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPHP41219 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPHP41219 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPHP41219 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPHP41219 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPHP41219 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPHP41219 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPHP41219 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPHP41219 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPHP41219 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPHP41219 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPHP41219 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPHP41219 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPHP41219 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPHP41219 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPHP41219 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPHP41219 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPHP41219 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPHP41219 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPHP41219 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPHP41219 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPHP41219 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPHP41219 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPHP41219 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPHP41219 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPHP41219 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPHP41219 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPHP41219 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPHP41219 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPHP41219 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPHP41219 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPHP41219 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPHP41219 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPHP41219 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPHP41219 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPHP41219 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPHP41219 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPHP41219 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPHP41219 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPHP41219 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPHP41219 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPHP41219 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPHP41219 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPHP41219 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPHP41219 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPHP41219 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPHP41219 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPHP41219 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPHP41219 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PRPHP41219 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PRPHP41219 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPHP41219 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPHP41219 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPHP41219 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPHP41219 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPHP41219 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPHP41219 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPHP41219 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPHP41219 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPHP41219 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPHP41219 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPHP41219 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPHP41219 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPHP41219 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPHP41219 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPHP41219 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPHP41219 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPHP41219 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPHP41219 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPHP41219 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPHP41219 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPHP41219 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPHP41219 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPHP41219 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPHP41219 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPHP41219 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPHP41219 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPHP41219 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPHP41219 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPHP41219 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPHP41219 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPHP41219 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPHP41219 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPHP41219 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPHP41219 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPHP41219 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPHP41219 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPHP41219 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPHP41219 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPHP41219 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms