Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARL1P40616 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARL1P40616 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARL1P40616 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARL1P40616 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARL1P40616 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARL1P40616 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARL1P40616 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARL1P40616 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARL1P40616 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARL1P40616 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ARL1P40616 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARL1P40616 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARL1P40616 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARL1P40616 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARL1P40616 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARL1P40616 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARL1P40616 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARL1P40616 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARL1P40616 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ARL1P40616 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARL1P40616 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARL1P40616 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARL1P40616 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARL1P40616 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARL1P40616 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARL1P40616 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARL1P40616 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARL1P40616 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARL1P40616 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARL1P40616 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARL1P40616 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARL1P40616 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARL1P40616 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARL1P40616 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARL1P40616 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARL1P40616 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARL1P40616 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARL1P40616 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARL1P40616 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARL1P40616 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARL1P40616 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARL1P40616 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARL1P40616 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARL1P40616 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARL1P40616 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARL1P40616 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARL1P40616 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARL1P40616 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARL1P40616 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARL1P40616 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARL1P40616 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARL1P40616 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARL1P40616 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARL1P40616 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARL1P40616 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ARL1P40616 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARL1P40616 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARL1P40616 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARL1P40616 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ARL1P40616 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARL1P40616 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARL1P40616 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARL1P40616 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARL1P40616 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARL1P40616 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARL1P40616 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARL1P40616 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARL1P40616 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARL1P40616 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARL1P40616 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARL1P40616 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARL1P40616 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARL1P40616 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARL1P40616 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARL1P40616 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARL1P40616 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARL1P40616 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARL1P40616 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARL1P40616 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARL1P40616 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARL1P40616 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ARL1P40616 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ARL1P40616 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARL1P40616 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARL1P40616 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARL1P40616 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARL1P40616 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARL1P40616 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARL1P40616 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARL1P40616 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARL1P40616 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ARL1P40616 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARL1P40616 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARL1P40616 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARL1P40616 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARL1P40616 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARL1P40616 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARL1P40616 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARL1P40616 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms