Protein–RNA interactions for Protein: P40429

RPL13A, 60S ribosomal protein L13a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13AP40429 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL13AP40429 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms