Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CHRNA7P36544 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms