Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KRT9P35527 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KRT9P35527 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT9P35527 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT9P35527 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT9P35527 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT9P35527 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT9P35527 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT9P35527 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT9P35527 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT9P35527 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT9P35527 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT9P35527 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT9P35527 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT9P35527 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT9P35527 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT9P35527 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT9P35527 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT9P35527 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT9P35527 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT9P35527 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT9P35527 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT9P35527 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT9P35527 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT9P35527 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT9P35527 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT9P35527 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT9P35527 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT9P35527 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT9P35527 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT9P35527 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT9P35527 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT9P35527 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT9P35527 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT9P35527 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT9P35527 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT9P35527 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT9P35527 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT9P35527 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT9P35527 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT9P35527 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT9P35527 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT9P35527 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT9P35527 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT9P35527 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT9P35527 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT9P35527 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT9P35527 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT9P35527 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT9P35527 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT9P35527 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT9P35527 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT9P35527 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT9P35527 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT9P35527 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT9P35527 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT9P35527 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT9P35527 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT9P35527 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT9P35527 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT9P35527 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT9P35527 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT9P35527 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT9P35527 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT9P35527 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT9P35527 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT9P35527 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT9P35527 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT9P35527 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT9P35527 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT9P35527 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT9P35527 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT9P35527 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT9P35527 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT9P35527 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT9P35527 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT9P35527 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT9P35527 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT9P35527 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT9P35527 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT9P35527 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT9P35527 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT9P35527 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT9P35527 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT9P35527 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT9P35527 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT9P35527 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT9P35527 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT9P35527 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT9P35527 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT9P35527 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT9P35527 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT9P35527 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT9P35527 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT9P35527 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT9P35527 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT9P35527 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT9P35527 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT9P35527 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT9P35527 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms