Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
THBS4P35443 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
THBS4P35443 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
THBS4P35443 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
THBS4P35443 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
THBS4P35443 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
THBS4P35443 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
THBS4P35443 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
THBS4P35443 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
THBS4P35443 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
THBS4P35443 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
THBS4P35443 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
THBS4P35443 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
THBS4P35443 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
THBS4P35443 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
THBS4P35443 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
THBS4P35443 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
THBS4P35443 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
THBS4P35443 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
THBS4P35443 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
THBS4P35443 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
THBS4P35443 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
THBS4P35443 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
THBS4P35443 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
THBS4P35443 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
THBS4P35443 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
THBS4P35443 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
THBS4P35443 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
THBS4P35443 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
THBS4P35443 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
THBS4P35443 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
THBS4P35443 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
THBS4P35443 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
THBS4P35443 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
THBS4P35443 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
THBS4P35443 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
THBS4P35443 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
THBS4P35443 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
THBS4P35443 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
THBS4P35443 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
THBS4P35443 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
THBS4P35443 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
THBS4P35443 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
THBS4P35443 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
THBS4P35443 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
THBS4P35443 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
THBS4P35443 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
THBS4P35443 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
THBS4P35443 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
THBS4P35443 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
THBS4P35443 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
THBS4P35443 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
THBS4P35443 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
THBS4P35443 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
THBS4P35443 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
THBS4P35443 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
THBS4P35443 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
THBS4P35443 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
THBS4P35443 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
THBS4P35443 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
THBS4P35443 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
THBS4P35443 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
THBS4P35443 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
THBS4P35443 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
THBS4P35443 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
THBS4P35443 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
THBS4P35443 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
THBS4P35443 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
THBS4P35443 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
THBS4P35443 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
THBS4P35443 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
THBS4P35443 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
THBS4P35443 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
THBS4P35443 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
THBS4P35443 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
THBS4P35443 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
THBS4P35443 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
THBS4P35443 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
THBS4P35443 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
THBS4P35443 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
THBS4P35443 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
THBS4P35443 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
THBS4P35443 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
THBS4P35443 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
THBS4P35443 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
THBS4P35443 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
THBS4P35443 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
THBS4P35443 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
THBS4P35443 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
THBS4P35443 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
THBS4P35443 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
THBS4P35443 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
THBS4P35443 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
THBS4P35443 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
THBS4P35443 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
THBS4P35443 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
THBS4P35443 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
THBS4P35443 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
THBS4P35443 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
THBS4P35443 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms