Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCKARP32238 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCKARP32238 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCKARP32238 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCKARP32238 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCKARP32238 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CCKARP32238 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCKARP32238 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCKARP32238 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCKARP32238 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCKARP32238 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCKARP32238 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCKARP32238 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCKARP32238 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCKARP32238 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCKARP32238 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCKARP32238 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCKARP32238 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCKARP32238 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCKARP32238 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCKARP32238 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCKARP32238 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCKARP32238 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCKARP32238 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCKARP32238 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCKARP32238 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCKARP32238 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCKARP32238 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCKARP32238 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCKARP32238 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCKARP32238 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCKARP32238 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCKARP32238 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCKARP32238 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCKARP32238 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCKARP32238 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCKARP32238 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCKARP32238 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCKARP32238 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCKARP32238 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCKARP32238 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCKARP32238 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCKARP32238 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCKARP32238 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCKARP32238 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCKARP32238 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCKARP32238 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCKARP32238 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCKARP32238 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCKARP32238 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCKARP32238 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCKARP32238 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCKARP32238 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCKARP32238 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCKARP32238 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCKARP32238 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCKARP32238 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCKARP32238 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCKARP32238 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCKARP32238 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCKARP32238 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCKARP32238 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCKARP32238 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCKARP32238 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCKARP32238 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCKARP32238 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCKARP32238 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCKARP32238 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCKARP32238 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCKARP32238 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCKARP32238 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCKARP32238 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCKARP32238 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCKARP32238 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCKARP32238 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCKARP32238 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCKARP32238 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCKARP32238 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCKARP32238 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCKARP32238 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCKARP32238 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCKARP32238 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCKARP32238 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCKARP32238 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCKARP32238 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCKARP32238 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCKARP32238 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCKARP32238 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCKARP32238 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCKARP32238 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCKARP32238 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCKARP32238 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCKARP32238 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCKARP32238 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCKARP32238 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCKARP32238 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCKARP32238 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCKARP32238 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCKARP32238 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCKARP32238 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms