Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ECHS1P30084 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ECHS1P30084 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ECHS1P30084 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ECHS1P30084 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ECHS1P30084 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ECHS1P30084 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ECHS1P30084 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ECHS1P30084 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ECHS1P30084 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ECHS1P30084 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ECHS1P30084 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ECHS1P30084 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ECHS1P30084 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ECHS1P30084 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ECHS1P30084 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ECHS1P30084 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ECHS1P30084 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ECHS1P30084 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ECHS1P30084 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECHS1P30084 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ECHS1P30084 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECHS1P30084 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECHS1P30084 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECHS1P30084 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECHS1P30084 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECHS1P30084 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECHS1P30084 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ECHS1P30084 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ECHS1P30084 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ECHS1P30084 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ECHS1P30084 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ECHS1P30084 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ECHS1P30084 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ECHS1P30084 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ECHS1P30084 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECHS1P30084 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECHS1P30084 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ECHS1P30084 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECHS1P30084 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECHS1P30084 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECHS1P30084 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ECHS1P30084 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ECHS1P30084 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ECHS1P30084 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ECHS1P30084 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ECHS1P30084 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ECHS1P30084 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ECHS1P30084 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ECHS1P30084 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ECHS1P30084 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ECHS1P30084 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ECHS1P30084 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ECHS1P30084 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ECHS1P30084 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ECHS1P30084 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ECHS1P30084 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ECHS1P30084 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ECHS1P30084 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ECHS1P30084 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ECHS1P30084 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ECHS1P30084 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ECHS1P30084 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ECHS1P30084 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ECHS1P30084 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ECHS1P30084 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ECHS1P30084 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ECHS1P30084 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ECHS1P30084 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ECHS1P30084 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ECHS1P30084 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ECHS1P30084 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ECHS1P30084 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ECHS1P30084 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ECHS1P30084 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ECHS1P30084 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ECHS1P30084 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ECHS1P30084 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ECHS1P30084 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ECHS1P30084 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ECHS1P30084 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ECHS1P30084 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ECHS1P30084 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ECHS1P30084 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECHS1P30084 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECHS1P30084 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECHS1P30084 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECHS1P30084 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECHS1P30084 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECHS1P30084 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECHS1P30084 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECHS1P30084 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECHS1P30084 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECHS1P30084 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECHS1P30084 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECHS1P30084 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECHS1P30084 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ECHS1P30084 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ECHS1P30084 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ECHS1P30084 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms